La sélection est à entendre comme “intégration des données dans l’entrepôt de données de santé”. Les services des structures disposant ou construisant un entrepôt de données de santé doivent savoir au préalable quelles données sont disponibles et pourraient être intégrées dans l’entrepôt. Le comité de pilotage définit une sélection des données nécessaires pour chaque source (dossier patient ou logiciel métier) qui seront à déverser dans l’entrepôt de données de santé. La mise en place technique de ce déversement dépend de l’infrastructure de chaque entrepôt de données de santé.
Il est important de noter qu’un projet d’entrepôt de données de santé est un projet évolutif (aspect technique) donc un établissement peut constituer un premier socle (périmètre de données) qui pourrait être enrichi par d’autres données.