Les entrepôts de données de santé sont alimentés par des données recueillies au moment du soin. Ces données sont des composantes explicites du Système national des données de santé (SNDS).
A terme, l’objectif est que les entrepôt de données de santé hospitaliers soient interopérables entre eux et avec le SNDS afin de permettre la remontée de données d’intérêt au niveau mutualisé national.