Parcours de soins TramineR

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Bonjour,

le package TRamine R est disponible avec R de même que la librairie WeightedCluster. Mais en revanche, j’ai compris depuis les tutoriels, que graphviz était nécessaire pour exploiter pleinement le package et, en effet, au moment décisif, je rencontre cette erreur :

seqtreedisplay(wardTree, type = « d », border = NA, show.depth = TRUE)
display: unable to open X server `:0’ @ error/display.c/DisplayImageCommand/410.

Comment surmonter ce problème ?

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Bonjour,

Pourriez-vous préciser sur quelles infrastructure vous travaillez ?

  • Si c’est sur la plateforme du HDH, nous vous invitons à vous rapprocher de l’opérateur projet qui vous accompagne et qui fera le nécessaire pour remonter votre besoin.

  • Si c’est sur le portail de la CNAM, nous vous invitons à suivre la procédure détaillée dans les documentations R présentes au niveau de l’onglet accueil :

La fonctionnalité d’installation de packages personnels est bloquée ; pour toute demande d’installation de nouveaux packages, vous pouvez adresser un ticket au supportnational@assurance-maladie.fr (objet du mail : [Création Demande de package RSTUDIO]) ou par S@M (RStudio >> effectuer une autre demande >> Objet : Demande de package RStudio), qui déploiera le nouveau package, une fois validé, à l’ensemble des utilisateurs. Vous pouvez suivre la liste des packages disponibles dans RStudio sur l’accueil du portail SNDS, dans la rubrique ‘Pour votre information’. La fréquence d’installation des packages est pour l’instant trimestrielle.

Bien cordialement,

Tim Vlaar - Health Data Hub

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Bonjour et merci pour ce soutien.

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Bonjour, je cherche donc une alternative à weightcluster, pour montrer les clusters de Traminer avez vous de suggestions ?

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Bonjour,

Cela relève d’une question technique sur R n’ayant pas vraiment trait aux données de la base principale du SNDS et sur laquelle nous sommes moins experts.
Vous pouvez essayer de poser la question à un chatbot basé sur IA générative, type ChatGPT, qui devrait pouvoir vous proposer des solutions.
En regardant rapidement de mon côté, les alternatives proposées sont : (1) factoextra, (2) ggplot2 avec geom_point ou geom_path, (3) TraMineR couplé à cluster et dendextend.

Bien cordialement,

Tim Vlaar - Health Data Hub

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Bonjour merci pour ce retour et effectivement ces Ia deviennent réellement des auxiliaires précieux. Merci en tout cas pour votre présence bienveillante à nos cotés .
Belle journée

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